Parece que Burr y Hamilton estaban casi destinados a luchar contra su famoso duelo en 1804 que resultó en la muerte de Hamilton y la muerte de la carrera política de Burr. Su animosidad mutua comenzó en 1791 cuando Aaron Burr capturó un escaño en el Senado del suegro de Hamilton, Philip Schuyler. La elección de 1800 calentó considerablemente los incendios del conflicto. Ese conflicto fue bastante complicado y requiere una breve explicación.
Uno de los defectos con la constitución original era que no hizo una distinción en la forma en que el Presidente y el Vicepresidente fueron elegidos por el Colegio Electoral. Originalmente, el candidato con la mayoría de los votos electorales se hizo presidentes y el candidato con la segunda mayoría de los votos se convirtió en vicepresidente. Este sistema defectuoso ayudó a convertir a Thomas Jefferson, un vicepresidente demócrata, vicepresidente del federalista John Adams en 1796.
para garantizar que los dos miembros principales del poder ejecutivo no sean miembros de diferentes partidos en Las elecciones de 1800, el republicano demócrata, que obtuvo muchos más votos que John Adams, planeó que todos sus electores voten tanto por Jefferson como por Burr, con la excepción de un elector que votaría solo por Jefferson. Sin embargo, ese plan falló, y tanto Burr como Jefferson obtuvieron exactamente el mismo número de votos. Esto envió las elecciones a la Cámara de Representantes. Después de muchas rondas de votación, la elección permaneció estancada. Mientras tanto, Burr comenzó a hacer campaña para hacerse presidente, en lugar de Jefferson. Para evitar que Burr se convierta en presidente, Alexander Hamilton convenció a los federalistas de apoyar a Jefferson.
Obviamente, esta furiosa enfureció, pero ese no fue el final de la oposición de Hamilton a Burr. Cuando Burr se dio cuenta de que estaba a punto de ser reemplazado como vicepresidente después de las elecciones de 1804, se postuló para gobernador de Nueva York. Hamilton luego hizo campaña contra Burr y apoyó a otro republicano demócrata. Burr perdido como resultado. Entre las derrotas electorales, Hamilton había diseñado contra Burr y los ataques incesantes que Hamilton realizó por Burr en muchos periódicos, no es de extrañar que Burr finalmente desafió a Hamilton a un duelo. Es igualmente sorprendente que Burr, siendo un caballero, se sintiera obligado a aceptar.
Es importante darse cuenta, sin embargo, que el conflicto fue más allá de la disgusto personal. Hamilton realmente creía que Burr era miembro de un partido político que eventualmente destruiría a los Estados Unidos. Independientemente de lo que haya pensado en los motivos personales de Burr, no había dudas en su mente cuáles serían las consecuencias de un éxito de república democrática. Por lo tanto, desafiante Burr era la forma en que Hamilton prevenía a alguien que él creía firmemente causaría un gran daño a la Unión que llegara al poder.